Besuche in den Anden und Chiclayo
Leo traf am Sonntag in Cusco ein, der ehemaligen Hauptstadt des Inka-Reiches, die auf einer Höhe von 3.400 Metern (mehr als 11.000 Fuß) liegt.
Der peruanische Kardinal Pedro Barreto sagte gegenüber der Associated Press, dass "Leo den von seinem Vorgänger, Papst Franziskus, vorgezeichneten Weg" im Bereich des Umweltschutzes und der Menschenrechte ebnen würde.
Als Nächstes wird der Papst nach Pucallpa reisen, einer Stadt im Amazonasgebiet, die gemeinsamen Bedrohungen durch Entwaldung und illegalen Bergbau ausgesetzt ist.
"Für uns ist die Ankunft des Papstes eine Quelle großer Freude, aber sie ist auch eine große Gelegenheit, unsere Forderungen, unsere Beschwerden und unsere Probleme Gehör zu verschaffen", sagte Cecilio Soria, ein indigener Menschenrechtsaktivist.
Zuvor hatte Leo am Samstag eine Open-Air-Messe in der Stadt Santa Cruz de Succhabamba gefeiert.
Er sprach mit Freude über die Rückkehr zu den "steilen Hügeln, Schluchten und fruchtbaren Tälern, in einem Land mit andinen Wurzeln, wo das Inka-Reich blühte und das die Wiege eines tiefen christlichen Glaubens ist."
Papst Leo feierte Messe in der kleinen Stadt Santa Cruz de Succhabamba, die in seinem ehemaligen Bistum Chiclayo liegt.
Leo besuchte auch die Stadt Zana, etwa 45 Kilometer (28 Meilen) südöstlich, die ein wichtiges Zentrum der afro-peruanischen Gesellschaft ist.
Leo, der im Mai seine Entschuldigung für die Rolle der Kirche beim transatlantischen Sklavenhandel aussprach, sagte, Zana "bewahrt die Erinnerung an Generationen von Afrikanern, die aus ihren Häusern gerissen und der Sklaverei unterworfen wurden."
"Viele ertrugen großes Leid und Demütigung. Liebe Brüder und Schwestern afrikanischer Abstammung, heute möchte ich meine Zuneigung und Nähe zu euch ausdrücken", sagte er.
"Danke für alles, was ihr zum Leben dieser Kirche beiträgt."