Colossal Biosciences推出GenoMorph人工智能平台用于渡渡鸟复活

Colossal Biosciences周三宣布推出GenoMorph，这是一个新的人工智能平台，旨在加速其复活灭绝物种的努力。该公司表示，该平台利用先进的3D形态学、比较基因组学和发育生物学，来识别在遗传数据稀缺的项目中可以进行编辑的基因。Colossal正将该工具应用于其渡渡鸟复活项目，与猛犸象项目相比，该项目面临显著的数据限制。

应对基因组数据有限的问题

渡渡鸟项目的主要挑战是完整基因组的稀缺。据该公司称，他们仅拥有一个渡渡鸟基因组，而猛犸象项目已获得100个基因组。Colossal解释说，猛犸象的DNA更为丰富，因为该动物居住的寒冷气候比渡渡鸟生活的热带环境更好地保存了DNA。

“通常，科学家可以比较许多基因组以了解哪些遗传差异导致了某些特征，”Colossal首席执行官兼联合创始人Ben Lamm告诉TechCrunch。“我们没有这种奢侈，对于来自灭绝物种的古代DNA，其DNA严重受限，我们只能获得少量完整基因组。”

Lamm表示，为了构建GenoMorph，该公司收集了“鸡、鹌鹑、鸭子和鸽子”的发育数据，并将其与“70多种鸟类的遗传信息和3D头骨测量数据”相结合。他指出，构建该平台花费了一年多的时间。人工智能学习在不同鸟类发育喙部和面部结构时DNA的哪些区域是活跃的，并利用这些信息预测哪些遗传开关可能赋予了渡渡鸟其标志性的外观。

识别编辑目标

据GamesBeat报道，该平台确定了与鸟类喙的大小和形状相关的约2,300个候选调控元件。Lamm表示：“到目前为止，我们已经确定了约2,300个有前景的渡渡鸟头面部形态DNA编辑目标，我们现在可以在实验室中测试它们。”他将该平台描述为“渡渡鸟基因组的藏宝图”，帮助团队找到真正重要的遗传差异，而不是在广泛的潜在差异中进行搜索。

Colossal首席科学官Beth Shapiro在一份声明中表示：“渡渡鸟的定义性解剖结构源于调控指令网络，仅凭古代DNA很难解读。”她补充说，GenoMorph使团队能够“优先考虑最有可能塑造渡渡鸟的调控变化，并将其转入功能验证。”

该公司还宣布了其尼科巴鸽种群（渡渡鸟现存最近的亲属）的进展。该种群现有36只鸟，该公司已成功创建了原始生殖细胞，即发育成卵子和精子的细胞。Lamm说：“因为尼科巴鸽是渡渡鸟现存最近的亲属，这些细胞是我们创造携带渡渡鸟特征的鸟类战略的关键部分。”

新的递送系统和投资

Colossal还详细介绍了一种使用脂质纳米颗粒将基因编辑工具直接递送到发育中的鸟类胚胎的新系统。Lamm表示，这使得团队能够观察遗传变化如何影响发育，“而无需等待需要鸟类达到性成熟的整个繁殖周期。”该公司报告称，编辑骨发育调节因子Runx2在实验中产生了明显的颅面表型，证明了该平台测试特定遗传变化的能力。

关于安全性，Lamm强调GenoMorph本身并不编辑基因，而是帮助识别哪些变化值得调查。他说：“确定潜在的编辑并不意味着我们立即将其引入动物或假设它是安全的。”“我们能够越精确地识别和验证这些变化，我们在整个过程中的决策就越明智。”

在相关新闻中，XPRIZE创始人、Colossal投资者Peter Diamandis宣布成立一家新的风险投资公司NeoGenesis Capital。Diamandis表示，该公司将支持使用Colossal Biosciences可编程生物学平台的公司，涵盖健康、农业和保护领域。

为何重要

GenoMorph的推出代表了灭绝生物学处理不完整数据方式的转变。通过利用人工智能对现存亲属的发育生物学进行建模，Colossal旨在克服古代DNA有限的瓶颈。如果成功，这种方法可以为其他大型种群基因组数据集不可用的灭绝物种提供可重复的框架。此外，这一举动标志着Colossal更广泛的商业战略，因为像Diamandis这样的投资者希望利用底层技术开发除复活灭绝物种之外的应用，包括农业和健康领域。

来源（英文）

• techcrunch.com: Colossal Biosciences announces new AI platform to help accelerate de-extinction efforts | TechCrunch
• techbuzz.ai: Colossal Biosciences Unveils AI Platform for De-Extinction | The Tech Buzz
• gamesbeat.com: Colossal Biosciences accelerates dodo bird de-extinction timeline - GamesBeat

本文由人工智能翻译自英文原文，并经过自动审核，确保与原文意思一致。来源已用英文核实。