Colossal Biosciences lanza GenoMorph AI para la desextinción del dodo

Colossal Biosciences anunció el miércoles el lanzamiento de GenoMorph, una nueva plataforma de inteligencia artificial diseñada para acelerar sus esfuerzos para traer de vuelta especies extintas. La empresa declaró que la plataforma utiliza morfología 3D avanzada, genómica comparativa y biología del desarrollo para identificar genes que podrían editarse en proyectos donde los datos genéticos son escasos. Colossal está aplicando la herramienta a su proyecto de desextinción del dodo, que enfrenta limitaciones de datos significativas en comparación con su iniciativa del mamut lanudo.

Abordando la limitación de datos genómicos

El principal desafío para el proyecto del dodo es la escasez de genomas completos. Según la empresa, está trabajando con solo un genoma de dodo, mientras que ha obtenido 100 genomas para el proyecto del mamut lanudo. Colossal explicó que el ADN del mamut lanudo es más abundante porque los climas más fríos en los que habitaba el animal preservaron mejor el ADN que los entornos tropicales donde vivía el dodo.

"Normalmente, los científicos pueden comparar muchos genomas para entender qué diferencias genéticas son responsables de ciertos rasgos", dijo el CEO y cofundador de Colossal, Ben Lamm, a TechCrunch. "No tenemos ese lujo con el ADN antiguo de especies extintas cuyo ADN está severamente limitado, y solo podemos obtener un pequeño número de genomas completos".

Para construir GenoMorph, Lamm dijo que la empresa recopiló datos de desarrollo de "pollos, codornices, patos y palomas", y los combinó con "información genética y mediciones 3D del cráneo de más de 70 especies de aves". Señaló que tomó más de un año de trabajo construir la plataforma. La IA aprende qué regiones del ADN están activas a medida que diferentes aves desarrollan sus picos y estructuras faciales, utilizando esa información para predecir qué interruptores genéticos pueden haberle dado al dodo su apariencia icónica.

Identificación de objetivos de edición

Según GamesBeat, la plataforma identificó aproximadamente 2.300 elementos reguladores candidatos asociados con el tamaño y la forma del pico aviar. Lamm declaró: "Hasta ahora hemos identificado aproximadamente 2.300 objetivos prometedores de edición de ADN para la morfología craneofacial del dodo que ahora podemos probar en el laboratorio". Describió la plataforma como un "mapa del tesoro para el genoma del dodo", ayudando al equipo a encontrar solo las diferencias genéticas que importan en lugar de buscar a través de una amplia gama de diferencias potenciales.

Beth Shapiro, Oficial Principal de Ciencia de Colossal, dijo en un comunicado: "La anatomía definitoria del dodo surgió de redes de instrucciones regulatorias que son difíciles de interpretar solo a partir del ADN antiguo". Añadió que GenoMorph permite al equipo "priorizar los cambios regulatorios más probables de haber moldeado al dodo y llevarlos a la validación funcional".

La empresa también anunció avances en su colonia de palomas de Nicobar, el pariente vivo más cercano del dodo. La colonia ahora tiene 36 aves, y la empresa ha creado con éxito células germinales primordiales, que son las células que se convierten en óvulos y espermatozoides. "Debido a que la paloma de Nicobar es el pariente vivo más cercano del dodo, esas células son una parte crítica de nuestra estrategia para crear aves que lleven rasgos de dodo", dijo Lamm.

Nuevos sistemas de entrega e inversión

Colossal también detalló un nuevo sistema que utiliza nanopartículas lipídicas para entregar herramientas de edición genética directamente en embriones de aves en desarrollo. Lamm dijo que esto permite al equipo ver cómo los cambios genéticos impactan el desarrollo "sin tener que esperar todo un ciclo de reproducción que requiere que las aves alcancen la madurez sexual". La empresa informó que editar el regulador del desarrollo óseo Runx2 produjo un fenotipo craneofacial claro en experimentos, demostrando la capacidad de la plataforma para probar cambios genéticos específicos.

En cuanto a la seguridad, Lamm enfatizó que GenoMorph no edita genes por sí mismo, sino que ayuda a identificar qué cambios valen la pena investigar. "Identificar una edición potencial no significa que la introduzcamos inmediatamente en un animal o asumamos que es segura", dijo. "Cuanto más precisamente podamos identificar y validar estos cambios, más informadas se vuelven nuestras decisiones a lo largo del proceso".

En noticias relacionadas, Peter Diamandis, fundador de XPRIZE e inversor en Colossal, anunció la fundación de una nueva firma de capital de riesgo, NeoGenesis Capital. Diamandis declaró que la firma respaldará a empresas que utilicen la plataforma de biología programable de Colossal Biosciences en salud, agricultura y conservación.

Por qué importa

El lanzamiento de GenoMorph representa un cambio en cómo la ciencia de la desextinción maneja datos incompletos. Al utilizar la IA para modelar la biología del desarrollo en parientes vivos, Colossal tiene como objetivo superar el cuello de botella del ADN antiguo limitado. Si tiene éxito, este enfoque podría proporcionar un marco repetible para otras especies extintas donde no hay disponibles conjuntos de datos genómicos de poblaciones grandes. Además, el movimiento señala una estrategia comercial más amplia para Colossal, ya que inversores como Diamandis buscan aprovechar la tecnología subyacente para aplicaciones más allá de la desextinción, incluyendo agricultura y salud.

Fuentes (en inglés)

• techcrunch.com: Colossal Biosciences announces new AI platform to help accelerate de-extinction efforts | TechCrunch
• techbuzz.ai: Colossal Biosciences Unveils AI Platform for De-Extinction | The Tech Buzz
• gamesbeat.com: Colossal Biosciences accelerates dodo bird de-extinction timeline - GamesBeat

Traducción con IA del artículo original en inglés, revisada automáticamente para que diga lo mismo que el original. Las fuentes fueron verificadas en inglés.